乾清宫内，朱由校正拥着张皇后，一同观看着魏进忠从民间搜集来的一座精雕细琢的小木屋，旁边摆放着《鲁班传》。
　　客氏让魏朝和魏进忠在殿外等候，自己独自进宫面圣。两名太监自是不敢言明，如果熹宗知道两人身子没有完全阉净，那两人将死无葬身之地！
　　客氏将事情的经过简略地讲述了一遍，大意是魏朝和魏进忠都想和她结成菜户，请求熹宗圣裁。熹宗对这事情不感兴趣，沉吟了片刻，说道：“你也着实不易，这事就由你自己区处罢。”
　　客氏听说大喜，谢过皇上，出得殿来，拉住魏进忠就走了，把魏朝丢在殿外，扬长而去。
　　皇后张嫣对魏朝以前利用宫女勾引熹宗之事有所耳闻，也建议熹宗治魏朝之罪。熹宗虽说不乐意，毕竟魏朝曾带给了他许多快乐，但碍于皇后的情面，吩咐将魏朝贬为一般太监，发落到洗衣房。魏朝见大势已去，自叹误养虎为患，反食自己，知道往后魏进忠不会放过自己，到洗衣房后没过多长时间，就用那根曾给客氏带来无数欢乐的裤带，结束了奋斗半辈子、风光半辈子的生命。
　　看到眼中之钉已除，魏进忠和客氏都很高兴，两人安安心心地做起了长久夫妻。事隔不久，客氏向熹宗推荐魏忠贤，让他重用。太监中最重要的司礼监，而司礼监中，又数秉笔太监权威最大，有时甚至可以直接起草诏书。平日里魏进忠很会讨好熹宗，朱由校对他印象不错，又见是奶娘请求，遂让魏进忠当了秉笔太监，执掌东厂，并赐名“魏忠贤”。
　　当上秉笔太监后，魏忠贤威信大增。他叫人在乾清宫内收拾了一片地，专门做为熹宗研究木匠活的场所，并备足刀斧锯勾、木料瓦片，十二名略懂木工技术的太监，随时听从熹宗的调遣。
　　熹宗性喜木工，一天不玩弄，就会寝食难安。魏忠贤这一举动，让他大喜过望，于是日日留连其间，日出而至，日落不离，把朝政抛到了脑后。魏忠贤看到这一情形，心生一计。以后凡有重要的奏章，就专挑熹宗迷醉于木工之时呈上去。往往熹宗看都不看，听魏忠贤口头说两句，就不耐烦地回道：“联已知晓，下去吧。”长此以往，整个朝廷竟被魏忠贤把持。
　　为了树立自己的帮派，排除异己，魏忠贤指使人上疏陷害朝中大臣，并动用东厂大狱、大刑，严刑逼供，制造了无数冤假错案，把朝臣有的打入天牢，有的流放边廷，有的杖责至死，有的抄家灭族，有的贬为平民，一大片正直的人惨遭毒手，一到晚上，东厂内鞭杖、呼号之声不绝于耳；一到白天，东厂的爪牙就群体出动，到处抓人，弄得人心惶惶，京城内无片刻宁静。与此同时，魏忠贤把一批趋炎附势的人提拔上来，把控了朝中的重要位置，阉党在朝中横行霸道，为所欲为。
　　不到两年，魏忠贤的爪牙遍布天下，许多平时目不识丁的人，只要攀附上了魏忠贤，马上连升几级。有些人还在全国各地为魏忠贤立了生祠，供上他的牌位。有些厚颜无耻的家伙，竟公然叫魏忠贤干爹，以此作为晋升之阶。
　　御使崔呈秀小有才华，却内心阴晦。为了向上爬，他放弃名节，奴颜婢膝地要魏忠贤收他为义子，并别出心裁地叫魏忠贤为“九千岁”。魏忠贤听了，想到皇上不过称万岁，自己和他只差一千岁，不由得心花怒放，立马让崔呈秀加官进爵。后来，又有人称魏忠贤为“九千九百九十九岁”，离“万岁”只差一岁，让魏忠贤更是飘飘然。
　　一时之间，魏忠贤权倾朝野，炙手可热。
　　许多刚正的朝臣看到朝中大事皆由阉党左右，不由得万分焦急，刚正不阿的东林党人杨涟、左光斗等纷纷上奏熹宗，让他清除阉党，剪除魏忠贤。由于魏忠贤掌管奏章，数百奏折还未与朱由校见面，就被魏忠贤枪毙。
　　御使方正儒见奏章未见结果，便暗中上了一疏，托大太监王安传给熹宗，说满朝文武和全国百姓只知有魏忠贤，不知另有皇帝。熹宗看了，询问魏忠贤。魏忠贤看了，内心甚为恐惧。他一面让客氏在朱由校耳旁吹风，一面在熹宗面前痛哭流涕，同时还佯装辞去了掌管东厂之职，请求出宫避祸。
　　糊里糊涂的熹宗不明就里，切实把魏忠贤抚慰了一番，下旨敕令诸臣不得擅自上奏，让群臣大失所望。
　　事后，魏忠贤传出矫旨，下令捕杀异党。自此，东厂大兴冤狱，东林首领杨涟、左光斗、袁化中、魏大中、周朝瑞、顾大章等六人被逮捕下狱。左光斗被五日一审，裸体受拶、夹、棍等刑，不能跪起，平卧堂下受讯，死于狱中。左光斗、魏大中被打死后均体无完肤，杨涟死状最为惨烈，土囊压身，铁钉贯耳，仅用血衣裹置在棺中。被押途中，都城士民数万拥道号泣。锦衣卫用尖刀剜出了杨涟喉骨送给了魏忠贤看，魏忠贤把那段喉骨烧成了灰，用烧酒伴着吞了下去。六人皆死，时称“六君子”。熊廷弼弃市，传首九边。各地东林讲学书院被毁，不附魏忠贤者，均被指为东林党，被夺官者达三百余人，下狱处死及流放边地者数十人。东厂和锦衣卫的缇骑四出，有人议论魏忠贤奸恶即被处死，甚至割舌剥皮。